Protein–RNA interactions for Protein: P05783

KRT18, Keratin, type I cytoskeletal 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT18P05783 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT18P05783 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT18P05783 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT18P05783 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT18P05783 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT18P05783 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT18P05783 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT18P05783 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT18P05783 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT18P05783 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT18P05783 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT18P05783 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT18P05783 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT18P05783 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT18P05783 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT18P05783 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT18P05783 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT18P05783 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT18P05783 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT18P05783 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT18P05783 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT18P05783 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT18P05783 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT18P05783 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT18P05783 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT18P05783 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT18P05783 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT18P05783 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT18P05783 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT18P05783 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT18P05783 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT18P05783 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT18P05783 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT18P05783 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT18P05783 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT18P05783 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT18P05783 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT18P05783 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT18P05783 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT18P05783 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT18P05783 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT18P05783 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT18P05783 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT18P05783 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT18P05783 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT18P05783 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT18P05783 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT18P05783 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT18P05783 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT18P05783 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT18P05783 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT18P05783 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT18P05783 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT18P05783 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT18P05783 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT18P05783 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT18P05783 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT18P05783 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT18P05783 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT18P05783 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT18P05783 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT18P05783 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT18P05783 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT18P05783 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT18P05783 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT18P05783 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT18P05783 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT18P05783 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT18P05783 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT18P05783 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT18P05783 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT18P05783 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT18P05783 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT18P05783 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT18P05783 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT18P05783 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT18P05783 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT18P05783 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT18P05783 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT18P05783 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT18P05783 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT18P05783 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT18P05783 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT18P05783 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT18P05783 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT18P05783 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT18P05783 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT18P05783 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT18P05783 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT18P05783 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT18P05783 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT18P05783 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT18P05783 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT18P05783 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT18P05783 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT18P05783 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT18P05783 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT18P05783 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT18P05783 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT18P05783 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms