Protein–RNA interactions for Protein: P04233

CD74, HLA class II histocompatibility antigen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD74P04233 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD74P04233 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD74P04233 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD74P04233 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD74P04233 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD74P04233 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CD74P04233 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD74P04233 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD74P04233 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD74P04233 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD74P04233 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD74P04233 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD74P04233 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD74P04233 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD74P04233 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD74P04233 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD74P04233 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD74P04233 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD74P04233 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD74P04233 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CD74P04233 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD74P04233 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD74P04233 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD74P04233 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD74P04233 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD74P04233 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD74P04233 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD74P04233 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD74P04233 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD74P04233 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD74P04233 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD74P04233 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CD74P04233 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CD74P04233 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CD74P04233 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD74P04233 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD74P04233 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD74P04233 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD74P04233 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD74P04233 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD74P04233 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD74P04233 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CD74P04233 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD74P04233 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD74P04233 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD74P04233 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD74P04233 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD74P04233 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD74P04233 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD74P04233 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD74P04233 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD74P04233 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD74P04233 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD74P04233 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD74P04233 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD74P04233 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD74P04233 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD74P04233 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD74P04233 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD74P04233 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD74P04233 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD74P04233 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CD74P04233 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD74P04233 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD74P04233 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD74P04233 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD74P04233 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD74P04233 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD74P04233 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD74P04233 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD74P04233 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD74P04233 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD74P04233 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD74P04233 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD74P04233 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD74P04233 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD74P04233 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD74P04233 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD74P04233 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD74P04233 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD74P04233 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD74P04233 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD74P04233 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD74P04233 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD74P04233 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD74P04233 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD74P04233 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD74P04233 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD74P04233 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD74P04233 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD74P04233 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD74P04233 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD74P04233 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD74P04233 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD74P04233 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD74P04233 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD74P04233 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD74P04233 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD74P04233 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD74P04233 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms