Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOA1P02647 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOA1P02647 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOA1P02647 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOA1P02647 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOA1P02647 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
APOA1P02647 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOA1P02647 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOA1P02647 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOA1P02647 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOA1P02647 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOA1P02647 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOA1P02647 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOA1P02647 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOA1P02647 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOA1P02647 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOA1P02647 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOA1P02647 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOA1P02647 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOA1P02647 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOA1P02647 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOA1P02647 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOA1P02647 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOA1P02647 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOA1P02647 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOA1P02647 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOA1P02647 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOA1P02647 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOA1P02647 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOA1P02647 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOA1P02647 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOA1P02647 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOA1P02647 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOA1P02647 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOA1P02647 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOA1P02647 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOA1P02647 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOA1P02647 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOA1P02647 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOA1P02647 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOA1P02647 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOA1P02647 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
APOA1P02647 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOA1P02647 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOA1P02647 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOA1P02647 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOA1P02647 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOA1P02647 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOA1P02647 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOA1P02647 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOA1P02647 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOA1P02647 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOA1P02647 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOA1P02647 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOA1P02647 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOA1P02647 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOA1P02647 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOA1P02647 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOA1P02647 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOA1P02647 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOA1P02647 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOA1P02647 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOA1P02647 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOA1P02647 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOA1P02647 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOA1P02647 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOA1P02647 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOA1P02647 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOA1P02647 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOA1P02647 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOA1P02647 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOA1P02647 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOA1P02647 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOA1P02647 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOA1P02647 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
APOA1P02647 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
APOA1P02647 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOA1P02647 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOA1P02647 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOA1P02647 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOA1P02647 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOA1P02647 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOA1P02647 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOA1P02647 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOA1P02647 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOA1P02647 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOA1P02647 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOA1P02647 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOA1P02647 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOA1P02647 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOA1P02647 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOA1P02647 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOA1P02647 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOA1P02647 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOA1P02647 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOA1P02647 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOA1P02647 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
APOA1P02647 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOA1P02647 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOA1P02647 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms