Protein–RNA interactions for Protein: P01100

FOS, Proto-oncogene c-Fos, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSP01100 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOSP01100 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOSP01100 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOSP01100 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOSP01100 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOSP01100 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOSP01100 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOSP01100 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOSP01100 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FOSP01100 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOSP01100 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOSP01100 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOSP01100 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FOSP01100 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FOSP01100 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOSP01100 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOSP01100 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FOSP01100 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FOSP01100 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FOSP01100 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FOSP01100 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOSP01100 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FOSP01100 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FOSP01100 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOSP01100 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
FOSP01100 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOSP01100 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOSP01100 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOSP01100 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOSP01100 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOSP01100 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOSP01100 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOSP01100 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOSP01100 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOSP01100 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOSP01100 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOSP01100 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOSP01100 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOSP01100 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOSP01100 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOSP01100 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOSP01100 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOSP01100 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOSP01100 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOSP01100 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOSP01100 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOSP01100 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOSP01100 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOSP01100 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOSP01100 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOSP01100 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOSP01100 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOSP01100 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOSP01100 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOSP01100 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOSP01100 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOSP01100 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOSP01100 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOSP01100 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOSP01100 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOSP01100 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FOSP01100 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOSP01100 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOSP01100 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOSP01100 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOSP01100 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOSP01100 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOSP01100 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOSP01100 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOSP01100 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOSP01100 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOSP01100 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOSP01100 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOSP01100 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOSP01100 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOSP01100 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOSP01100 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOSP01100 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOSP01100 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOSP01100 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOSP01100 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOSP01100 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOSP01100 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOSP01100 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOSP01100 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOSP01100 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FOSP01100 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOSP01100 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOSP01100 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOSP01100 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOSP01100 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOSP01100 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FOSP01100 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOSP01100 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOSP01100 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOSP01100 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOSP01100 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOSP01100 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOSP01100 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOSP01100 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms