Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
APBA3O96018 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
APBA3O96018 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
APBA3O96018 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
APBA3O96018 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
APBA3O96018 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
APBA3O96018 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
APBA3O96018 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
APBA3O96018 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
APBA3O96018 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
APBA3O96018 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
APBA3O96018 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
APBA3O96018 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
APBA3O96018 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
APBA3O96018 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
APBA3O96018 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
APBA3O96018 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
APBA3O96018 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
APBA3O96018 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
APBA3O96018 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
APBA3O96018 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
APBA3O96018 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
APBA3O96018 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
APBA3O96018 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
APBA3O96018 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
APBA3O96018 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
APBA3O96018 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
APBA3O96018 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
APBA3O96018 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
APBA3O96018 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
APBA3O96018 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
APBA3O96018 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
APBA3O96018 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
APBA3O96018 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
APBA3O96018 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
APBA3O96018 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
APBA3O96018 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
APBA3O96018 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
APBA3O96018 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
APBA3O96018 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
APBA3O96018 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
APBA3O96018 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
APBA3O96018 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
APBA3O96018 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
APBA3O96018 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
APBA3O96018 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
APBA3O96018 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
APBA3O96018 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
APBA3O96018 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
APBA3O96018 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
APBA3O96018 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
APBA3O96018 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
APBA3O96018 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
APBA3O96018 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
APBA3O96018 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
APBA3O96018 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
APBA3O96018 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
APBA3O96018 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
APBA3O96018 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
APBA3O96018 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
APBA3O96018 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
APBA3O96018 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
APBA3O96018 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
APBA3O96018 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
APBA3O96018 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
APBA3O96018 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
APBA3O96018 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
APBA3O96018 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
APBA3O96018 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
APBA3O96018 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
APBA3O96018 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
APBA3O96018 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
APBA3O96018 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
APBA3O96018 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
APBA3O96018 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
APBA3O96018 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
APBA3O96018 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
APBA3O96018 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
APBA3O96018 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
APBA3O96018 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
APBA3O96018 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
APBA3O96018 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
APBA3O96018 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
APBA3O96018 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
APBA3O96018 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
APBA3O96018 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
APBA3O96018 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
APBA3O96018 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
APBA3O96018 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
APBA3O96018 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
APBA3O96018 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
APBA3O96018 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
APBA3O96018 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
APBA3O96018 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
APBA3O96018 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
APBA3O96018 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
APBA3O96018 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
APBA3O96018 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
APBA3O96018 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
APBA3O96018 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms