Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRUB2O95900 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRUB2O95900 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms