Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNDBP1O95273 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.28■■□□□ 1
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