Protein–RNA interactions for Protein: O95197

RTN3, Reticulon-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN3O95197 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTN3O95197 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTN3O95197 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN3O95197 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN3O95197 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN3O95197 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN3O95197 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN3O95197 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN3O95197 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN3O95197 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN3O95197 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN3O95197 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN3O95197 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN3O95197 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN3O95197 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN3O95197 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN3O95197 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RTN3O95197 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RTN3O95197 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTN3O95197 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTN3O95197 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RTN3O95197 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTN3O95197 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTN3O95197 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTN3O95197 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTN3O95197 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTN3O95197 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTN3O95197 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN3O95197 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN3O95197 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN3O95197 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN3O95197 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN3O95197 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN3O95197 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN3O95197 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN3O95197 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN3O95197 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN3O95197 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN3O95197 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN3O95197 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN3O95197 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN3O95197 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN3O95197 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTN3O95197 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN3O95197 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN3O95197 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN3O95197 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN3O95197 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN3O95197 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN3O95197 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN3O95197 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN3O95197 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN3O95197 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN3O95197 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN3O95197 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN3O95197 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN3O95197 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTN3O95197 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN3O95197 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN3O95197 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN3O95197 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN3O95197 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN3O95197 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN3O95197 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN3O95197 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN3O95197 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN3O95197 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN3O95197 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN3O95197 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN3O95197 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN3O95197 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN3O95197 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN3O95197 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN3O95197 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN3O95197 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTN3O95197 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN3O95197 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN3O95197 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN3O95197 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN3O95197 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN3O95197 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN3O95197 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN3O95197 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN3O95197 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTN3O95197 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN3O95197 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN3O95197 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN3O95197 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN3O95197 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN3O95197 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN3O95197 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN3O95197 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN3O95197 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN3O95197 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN3O95197 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN3O95197 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN3O95197 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN3O95197 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTN3O95197 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTN3O95197 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms