Protein–RNA interactions for Protein: O94988

FAM13A, Protein FAM13A, humanhuman

Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM13AO94988 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM13AO94988 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM13AO94988 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms