Protein–RNA interactions for Protein: O60890

OPHN1, Oligophrenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPHN1O60890 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OPHN1O60890 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OPHN1O60890 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OPHN1O60890 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OPHN1O60890 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OPHN1O60890 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OPHN1O60890 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OPHN1O60890 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OPHN1O60890 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms