Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRAMEF10O60809 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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PRAMEF10O60809 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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