Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CREB3O43889 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CREB3O43889 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CREB3O43889 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CREB3O43889 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CREB3O43889 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CREB3O43889 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CREB3O43889 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CREB3O43889 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CREB3O43889 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CREB3O43889 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CREB3O43889 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CREB3O43889 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CREB3O43889 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CREB3O43889 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CREB3O43889 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CREB3O43889 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CREB3O43889 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CREB3O43889 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CREB3O43889 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CREB3O43889 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CREB3O43889 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CREB3O43889 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CREB3O43889 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CREB3O43889 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CREB3O43889 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CREB3O43889 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CREB3O43889 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CREB3O43889 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CREB3O43889 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CREB3O43889 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CREB3O43889 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CREB3O43889 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CREB3O43889 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CREB3O43889 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CREB3O43889 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3O43889 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3O43889 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3O43889 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3O43889 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3O43889 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3O43889 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3O43889 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3O43889 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3O43889 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3O43889 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3O43889 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3O43889 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3O43889 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3O43889 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3O43889 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3O43889 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3O43889 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3O43889 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3O43889 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3O43889 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3O43889 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3O43889 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3O43889 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3O43889 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3O43889 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3O43889 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3O43889 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3O43889 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3O43889 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CREB3O43889 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CREB3O43889 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CREB3O43889 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CREB3O43889 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CREB3O43889 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CREB3O43889 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CREB3O43889 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CREB3O43889 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CREB3O43889 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CREB3O43889 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CREB3O43889 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CREB3O43889 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CREB3O43889 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CREB3O43889 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CREB3O43889 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CREB3O43889 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CREB3O43889 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CREB3O43889 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CREB3O43889 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CREB3O43889 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CREB3O43889 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB3O43889 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB3O43889 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB3O43889 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB3O43889 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB3O43889 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB3O43889 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB3O43889 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB3O43889 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB3O43889 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB3O43889 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB3O43889 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB3O43889 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB3O43889 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB3O43889 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms