Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP9O43818 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP9O43818 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP9O43818 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP9O43818 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP9O43818 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP9O43818 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP9O43818 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP9O43818 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP9O43818 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP9O43818 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP9O43818 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP9O43818 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP9O43818 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP9O43818 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRP9O43818 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRP9O43818 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRP9O43818 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRP9O43818 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRP9O43818 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRP9O43818 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRP9O43818 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRP9O43818 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRP9O43818 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRP9O43818 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRP9O43818 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRP9O43818 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRP9O43818 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RRP9O43818 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RRP9O43818 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RRP9O43818 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RRP9O43818 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RRP9O43818 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRP9O43818 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRP9O43818 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRP9O43818 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRP9O43818 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRP9O43818 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRP9O43818 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP9O43818 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP9O43818 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP9O43818 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP9O43818 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP9O43818 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP9O43818 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP9O43818 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP9O43818 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP9O43818 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP9O43818 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP9O43818 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP9O43818 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP9O43818 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP9O43818 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP9O43818 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP9O43818 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP9O43818 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP9O43818 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP9O43818 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP9O43818 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP9O43818 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP9O43818 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP9O43818 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP9O43818 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP9O43818 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP9O43818 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP9O43818 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP9O43818 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP9O43818 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP9O43818 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP9O43818 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP9O43818 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP9O43818 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP9O43818 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP9O43818 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP9O43818 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP9O43818 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP9O43818 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP9O43818 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP9O43818 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP9O43818 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP9O43818 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP9O43818 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP9O43818 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP9O43818 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP9O43818 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP9O43818 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP9O43818 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP9O43818 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP9O43818 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP9O43818 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP9O43818 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP9O43818 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP9O43818 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP9O43818 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP9O43818 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP9O43818 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP9O43818 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RRP9O43818 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RRP9O43818 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RRP9O43818 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms