Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR2O43760 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms