Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCXO43602 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCXO43602 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCXO43602 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCXO43602 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCXO43602 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCXO43602 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCXO43602 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCXO43602 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCXO43602 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCXO43602 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DCXO43602 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCXO43602 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCXO43602 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCXO43602 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCXO43602 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCXO43602 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCXO43602 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCXO43602 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCXO43602 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCXO43602 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCXO43602 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCXO43602 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCXO43602 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DCXO43602 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCXO43602 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCXO43602 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCXO43602 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCXO43602 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCXO43602 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCXO43602 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCXO43602 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCXO43602 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCXO43602 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCXO43602 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCXO43602 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCXO43602 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCXO43602 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCXO43602 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DCXO43602 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCXO43602 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCXO43602 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCXO43602 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCXO43602 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DCXO43602 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCXO43602 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCXO43602 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCXO43602 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCXO43602 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCXO43602 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DCXO43602 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCXO43602 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCXO43602 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCXO43602 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCXO43602 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCXO43602 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCXO43602 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCXO43602 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCXO43602 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCXO43602 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCXO43602 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCXO43602 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DCXO43602 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DCXO43602 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCXO43602 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCXO43602 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DCXO43602 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCXO43602 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCXO43602 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCXO43602 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCXO43602 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCXO43602 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCXO43602 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCXO43602 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCXO43602 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCXO43602 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DCXO43602 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCXO43602 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCXO43602 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCXO43602 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCXO43602 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DCXO43602 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCXO43602 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCXO43602 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCXO43602 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCXO43602 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCXO43602 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCXO43602 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCXO43602 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCXO43602 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCXO43602 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCXO43602 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCXO43602 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCXO43602 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCXO43602 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCXO43602 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCXO43602 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCXO43602 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCXO43602 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCXO43602 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms