Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8B1O43520 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP8B1O43520 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP8B1O43520 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms