Protein–RNA interactions for Protein: O43482

OIP5, Protein Mis18-beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OIP5O43482 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OIP5O43482 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OIP5O43482 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OIP5O43482 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OIP5O43482 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OIP5O43482 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OIP5O43482 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
OIP5O43482 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OIP5O43482 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OIP5O43482 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OIP5O43482 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OIP5O43482 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OIP5O43482 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OIP5O43482 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OIP5O43482 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OIP5O43482 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OIP5O43482 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OIP5O43482 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OIP5O43482 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OIP5O43482 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OIP5O43482 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
OIP5O43482 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OIP5O43482 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OIP5O43482 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OIP5O43482 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OIP5O43482 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OIP5O43482 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OIP5O43482 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OIP5O43482 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OIP5O43482 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OIP5O43482 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OIP5O43482 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OIP5O43482 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OIP5O43482 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
OIP5O43482 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OIP5O43482 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OIP5O43482 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OIP5O43482 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OIP5O43482 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OIP5O43482 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OIP5O43482 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OIP5O43482 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OIP5O43482 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OIP5O43482 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OIP5O43482 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OIP5O43482 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OIP5O43482 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OIP5O43482 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OIP5O43482 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OIP5O43482 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OIP5O43482 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OIP5O43482 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OIP5O43482 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OIP5O43482 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OIP5O43482 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OIP5O43482 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OIP5O43482 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OIP5O43482 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OIP5O43482 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OIP5O43482 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
OIP5O43482 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OIP5O43482 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OIP5O43482 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OIP5O43482 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OIP5O43482 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OIP5O43482 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OIP5O43482 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OIP5O43482 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
OIP5O43482 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OIP5O43482 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OIP5O43482 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OIP5O43482 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OIP5O43482 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OIP5O43482 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OIP5O43482 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OIP5O43482 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OIP5O43482 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OIP5O43482 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OIP5O43482 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OIP5O43482 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OIP5O43482 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OIP5O43482 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OIP5O43482 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OIP5O43482 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OIP5O43482 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OIP5O43482 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OIP5O43482 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OIP5O43482 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OIP5O43482 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OIP5O43482 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OIP5O43482 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OIP5O43482 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OIP5O43482 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
OIP5O43482 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OIP5O43482 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
OIP5O43482 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OIP5O43482 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OIP5O43482 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OIP5O43482 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OIP5O43482 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms