Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNAB3O43448 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNAB3O43448 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNAB3O43448 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNAB3O43448 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNAB3O43448 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNAB3O43448 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNAB3O43448 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNAB3O43448 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNAB3O43448 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNAB3O43448 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNAB3O43448 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNAB3O43448 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNAB3O43448 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNAB3O43448 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNAB3O43448 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNAB3O43448 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNAB3O43448 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNAB3O43448 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNAB3O43448 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNAB3O43448 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNAB3O43448 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNAB3O43448 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNAB3O43448 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNAB3O43448 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNAB3O43448 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNAB3O43448 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNAB3O43448 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNAB3O43448 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNAB3O43448 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNAB3O43448 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNAB3O43448 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNAB3O43448 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNAB3O43448 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNAB3O43448 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNAB3O43448 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNAB3O43448 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms