Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD3O43242 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PSMD3O43242 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms