Protein–RNA interactions for Protein: O14561

NDUFAB1, Acyl carrier protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAB1O14561 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFAB1O14561 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFAB1O14561 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms