Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QQQ9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QQQ9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QQQ9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QQQ9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QQQ9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QQQ9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QQQ9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QQQ9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QQQ9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QQQ9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QQQ9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QQQ9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QQQ9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QQQ9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QQQ9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QQQ9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QQQ9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QQQ9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QQQ9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3QQQ9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3QQQ9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3QQQ9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3QQQ9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3QQQ9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3QQQ9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3QQQ9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3QQQ9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3QQQ9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3QQQ9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3QQQ9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3QQQ9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3QQQ9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3QQQ9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3QQQ9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3QQQ9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3QQQ9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3QQQ9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3QQQ9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3QQQ9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3QQQ9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3QQQ9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3QQQ9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3QQQ9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3QQQ9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3QQQ9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3QQQ9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3QQQ9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3QQQ9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3QQQ9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3QQQ9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3QQQ9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3QQQ9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
J3QQQ9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3QQQ9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3QQQ9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3QQQ9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3QQQ9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3QQQ9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3QQQ9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3QQQ9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3QQQ9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3QQQ9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3QQQ9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3QQQ9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3QQQ9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3QQQ9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3QQQ9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3QQQ9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
J3QQQ9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3QQQ9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3QQQ9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3QQQ9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3QQQ9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3QQQ9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
J3QQQ9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3QQQ9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3QQQ9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3QQQ9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3QQQ9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3QQQ9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3QQQ9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3QQQ9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3QQQ9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3QQQ9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3QQQ9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3QQQ9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3QQQ9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3QQQ9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
J3QQQ9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
J3QQQ9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3QQQ9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
J3QQQ9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3QQQ9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3QQQ9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3QQQ9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.08■□□□□ 0
J3QQQ9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
J3QQQ9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
J3QQQ9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3QQQ9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms