Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3KT08 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3KT08 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3KT08 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3KT08 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3KT08 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3KT08 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3KT08 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3KT08 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3KT08 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3KT08 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3KT08 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
J3KT08 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
J3KT08 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
J3KT08 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
J3KT08 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
J3KT08 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3KT08 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3KT08 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3KT08 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3KT08 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3KT08 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3KT08 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3KT08 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3KT08 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3KT08 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3KT08 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3KT08 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3KT08 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3KT08 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3KT08 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3KT08 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3KT08 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
J3KT08 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3KT08 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3KT08 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3KT08 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3KT08 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3KT08 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3KT08 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3KT08 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3KT08 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3KT08 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3KT08 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3KT08 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3KT08 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3KT08 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3KT08 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3KT08 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3KT08 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3KT08 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3KT08 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3KT08 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3KT08 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3KT08 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3KT08 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3KT08 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3KT08 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3KT08 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3KT08 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
J3KT08 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3KT08 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3KT08 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3KT08 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3KT08 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3KT08 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3KT08 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3KT08 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3KT08 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3KT08 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3KT08 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3KT08 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3KT08 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3KT08 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3KT08 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3KT08 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3KT08 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3KT08 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3KT08 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3KT08 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3KT08 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3KT08 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3KT08 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3KT08 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3KT08 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
J3KT08 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
J3KT08 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3KT08 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3KT08 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3KT08 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3KT08 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
J3KT08 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3KT08 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3KT08 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3KT08 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3KT08 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3KT08 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3KT08 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3KT08 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3KT08 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms