Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LINC01387J3KSC0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LINC01387J3KSC0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LINC01387J3KSC0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LINC01387J3KSC0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LINC01387J3KSC0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LINC01387J3KSC0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LINC01387J3KSC0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LINC01387J3KSC0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC01387J3KSC0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC01387J3KSC0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC01387J3KSC0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC01387J3KSC0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC01387J3KSC0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC01387J3KSC0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC01387J3KSC0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC01387J3KSC0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC01387J3KSC0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC01387J3KSC0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC01387J3KSC0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC01387J3KSC0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC01387J3KSC0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC01387J3KSC0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC01387J3KSC0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC01387J3KSC0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC01387J3KSC0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC01387J3KSC0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC01387J3KSC0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC01387J3KSC0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LINC01387J3KSC0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LINC01387J3KSC0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LINC01387J3KSC0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LINC01387J3KSC0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
LINC01387J3KSC0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LINC01387J3KSC0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms