Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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