Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA8SH3BPF8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
GOLGA8SH3BPF8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms