Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NPIPB9F8W1W9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms