Protein–RNA interactions for Protein: A6NNZ2

Tubulin beta-8 chain-like protein LOC260334, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNZ2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A6NNZ2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A6NNZ2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A6NNZ2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A6NNZ2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A6NNZ2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A6NNZ2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A6NNZ2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A6NNZ2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A6NNZ2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A6NNZ2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A6NNZ2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A6NNZ2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
A6NNZ2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A6NNZ2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A6NNZ2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A6NNZ2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A6NNZ2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A6NNZ2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A6NNZ2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A6NNZ2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A6NNZ2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A6NNZ2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A6NNZ2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A6NNZ2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A6NNZ2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A6NNZ2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A6NNZ2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A6NNZ2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A6NNZ2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A6NNZ2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A6NNZ2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A6NNZ2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A6NNZ2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A6NNZ2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A6NNZ2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A6NNZ2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A6NNZ2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A6NNZ2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A6NNZ2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A6NNZ2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A6NNZ2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A6NNZ2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A6NNZ2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
A6NNZ2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
A6NNZ2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A6NNZ2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
A6NNZ2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
A6NNZ2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A6NNZ2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
A6NNZ2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A6NNZ2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A6NNZ2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A6NNZ2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A6NNZ2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A6NNZ2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A6NNZ2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A6NNZ2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A6NNZ2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A6NNZ2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NNZ2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NNZ2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NNZ2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NNZ2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NNZ2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NNZ2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NNZ2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NNZ2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NNZ2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NNZ2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NNZ2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NNZ2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NNZ2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NNZ2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NNZ2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NNZ2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NNZ2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NNZ2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NNZ2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NNZ2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NNZ2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NNZ2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NNZ2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NNZ2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NNZ2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NNZ2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NNZ2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NNZ2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NNZ2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NNZ2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A6NNZ2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
A6NNZ2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A6NNZ2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A6NNZ2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A6NNZ2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A6NNZ2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A6NNZ2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
A6NNZ2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A6NNZ2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A6NNZ2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms