Protein–RNA interactions for Protein: A6NK53

ZNF233, Zinc finger protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF233A6NK53 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF233A6NK53 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF233A6NK53 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms