Protein–RNA interactions for Protein: A6NHY6

C9orf118, Putative uncharacterized protein C9orf118, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf118A6NHY6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf118A6NHY6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms