Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GMNCA6NCL1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms