Protein–RNA interactions for Protein: A2A3L6

TTC24, Tetratricopeptide repeat protein 24, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC24A2A3L6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC24A2A3L6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC24A2A3L6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC24A2A3L6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC24A2A3L6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC24A2A3L6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC24A2A3L6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC24A2A3L6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC24A2A3L6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC24A2A3L6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC24A2A3L6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC24A2A3L6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC24A2A3L6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC24A2A3L6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC24A2A3L6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC24A2A3L6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC24A2A3L6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC24A2A3L6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC24A2A3L6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC24A2A3L6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC24A2A3L6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC24A2A3L6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC24A2A3L6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC24A2A3L6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC24A2A3L6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC24A2A3L6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC24A2A3L6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC24A2A3L6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC24A2A3L6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC24A2A3L6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC24A2A3L6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC24A2A3L6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC24A2A3L6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC24A2A3L6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms