Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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