Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 SLC27A6-203ENST00000506176 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 DUSP4-202ENST00000240101 2959 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 ZNF771-204ENST00000566625 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 HPSE2-201ENST00000370546 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 HNRNPLP1-201ENST00000421896 1501 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 PDP1-202ENST00000396200 4358 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 UBP1-204ENST00000447368 3669 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 FAM105A-201ENST00000274217 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 ARAP1-209ENST00000455638 2683 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 HJURP-204ENST00000432087 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 NRXN1-233ENST00000630543 4500 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 ABI1-212ENST00000490841 3188 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 ARID4A-206ENST00000431317 5783 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 NSUN4-204ENST00000474844 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 CACNA2D3-AS1-201ENST00000471265 2078 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 CNKSR2-207ENST00000543067 4355 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 AL139011.2-201ENST00000556710 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 ELMOD3-202ENST00000393852 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 AP002754.1-201ENST00000506329 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 STRA6-204ENST00000423167 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 P2RX1-201ENST00000225538 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 NUP58-206ENST00000463407 6360 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 ZCRB1-201ENST00000266529 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 RBM22P2-201ENST00000393978 1814 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 USP20-202ENST00000358355 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 IQSEC1-204ENST00000613206 3582 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SORCS2Q96PQ0 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms