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| PTPRJ | Q12913 | SLC22A2-202 | ENST00000366953 | 2597 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.04 | □□□□□ -0.16 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TBC1D24-201 | ENST00000293970 | 4340 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 14.04 | □□□□□ -0.16 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TFR2-205 | ENST00000462107 | 3131 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 14.04 | □□□□□ -0.16 | | |
| PTPRJ | Q12913 | WTAPP1-202 | ENST00000525739 | 2642 nt | TSL 2 BASIC | 14.04 | □□□□□ -0.16 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MED16-204 | ENST00000395808 | 3420 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 14.03 | □□□□□ -0.16 | | |
| PTPRJ | Q12913 | DPY19L2P2-205 | ENST00000439473 | 3994 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.03 | □□□□□ -0.16 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SLC2A9-208 | ENST00000506583 | 1927 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 14.03 | □□□□□ -0.16 | | |
| PTPRJ | Q12913 | BDH1-202 | ENST00000392378 | 3455 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.03 | □□□□□ -0.16 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SGCA-201 | ENST00000262018 | 1432 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.03 | □□□□□ -0.16 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | LDLR-203 | ENST00000535915 | 2768 nt | TSL 2 BASIC | 14.03 | □□□□□ -0.16 | | |
| PTPRJ | Q12913 | COPS7A-201 | ENST00000229251 | 1721 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.03 | □□□□□ -0.16 | | |
| PTPRJ | Q12913 | NUP133-201 | ENST00000261396 | 5207 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.03 | □□□□□ -0.16 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | CR382285.1-201 | ENST00000625012 | 1485 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.03 | □□□□□ -0.16 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | TLE3-220 | ENST00000559929 | 3408 nt | TSL 5 BASIC | 14.03 | □□□□□ -0.16 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | CREBZF-204 | ENST00000527447 | 4037 nt | APPRIS P1 BASIC | 14.03 | □□□□□ -0.16 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TWSG1-201 | ENST00000262120 | 3756 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.03 | □□□□□ -0.16 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | MYH7-201 | ENST00000355349 | 6087 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.03 | □□□□□ -0.16 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RANGRF-201 | ENST00000226105 | 1009 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.03 | □□□□□ -0.16 | | |
| PTPRJ | Q12913 | C16orf78-201 | ENST00000299191 | 1068 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.03 | □□□□□ -0.16 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | FHIT-205 | ENST00000476844 | 1033 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.03 | □□□□□ -0.16 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | RALGDS-203 | ENST00000372062 | 3596 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 14.03 | □□□□□ -0.16 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | SH2D3C-201 | ENST00000314830 | 3124 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 14.03 | □□□□□ -0.16 | | |
| PTPRJ | Q12913 | STEAP2-202 | ENST00000394621 | 7033 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.03 | □□□□□ -0.16 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | RAPH1-202 | ENST00000319170 | 9808 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 14.02 | □□□□□ -0.16 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | NAPEPLD-201 | ENST00000341533 | 4972 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.02 | □□□□□ -0.16 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | BBOX1-AS1-204 | ENST00000531363 | 745 nt | TSL 2 BASIC | 14.02 | □□□□□ -0.17 | | |
| PTPRJ | Q12913 | IFI27L1-209 | ENST00000555523 | 680 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 14.02 | □□□□□ -0.17 | | |
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