Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SAP18-208ENST00000621421 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 WTAPP1-202ENST00000525739 2642 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 SLC2A9-208ENST00000506583 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 LDLR-203ENST00000535915 2768 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 COPS7A-201ENST00000229251 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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PTPRJQ12913 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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PTPRJQ12913 C16orf78-201ENST00000299191 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 GZMH-202ENST00000382548 687 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 AP001331.1-201ENST00000413008 1015 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 AP000346.2-202ENST00000425948 383 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 P2RX6P-202ENST00000450626 357 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 AC011603.2-201ENST00000548149 675 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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PTPRJQ12913 IFI27L1-209ENST00000555523 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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PTPRJQ12913 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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