Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AC106774.10-201ENST00000638486 599 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 RCBTB2-206ENST00000544904 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC023830.3-201ENST00000612995 1455 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 CDC16-201ENST00000252457 2034 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 CDC16-205ENST00000375308 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 SRSF5-201ENST00000394366 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 VOPP1-206ENST00000428097 1671 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 CPLX4-201ENST00000299721 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 COX17-201ENST00000261070 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 OGFRP1-201ENST00000332965 1242 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 MRPL55-207ENST00000366733 834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 HNRNPA1P33-201ENST00000421426 561 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC009312.1-201ENST00000457110 592 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC003072.1-201ENST00000510957 612 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC109635.1-201ENST00000529200 490 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AL139022.1-202ENST00000553633 796 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 MPI-212ENST00000565576 1148 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 TSPAN16-204ENST00000590327 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 MIR6511B1-201ENST00000612014 85 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 FAM183BP-201ENST00000409072 1595 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 RYR1-201ENST00000355481 15377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 NDEL1-203ENST00000402554 1858 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 KNSTRN-203ENST00000448395 1464 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 DDX11L1-202ENST00000456328 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 DDX11L10-202ENST00000513886 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 DDX11L9-203ENST00000562189 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ACR-201ENST00000216139 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AL591368.1-201ENST00000437181 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 TSGA10-201ENST00000355053 3037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 FAM76A-202ENST00000234549 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 OR8J3-201ENST00000301529 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 MED15P7-201ENST00000435410 822 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC140481.1-202ENST00000436488 525 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 YBX1P9-201ENST00000441264 679 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC064807.3-201ENST00000523810 470 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 FAM76A-207ENST00000530324 1027 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC009088.4-201ENST00000575892 280 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC068620.2-201ENST00000602927 529 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 SSX3-204ENST00000612497 1030 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC087893.1-201ENST00000612818 664 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 FAM156A-223ENST00000623782 1931 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 SGCE-201ENST00000265735 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 RABL2B-203ENST00000395591 1987 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 IGLV1-44-201ENST00000390297 467 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 KRTAP12-4-201ENST00000391618 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 RPS7-202ENST00000403564 764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 U2AF1L4-203ENST00000412391 904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 SYP-AS1-201ENST00000433499 542 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 FTLP16-201ENST00000446400 513 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms