Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6S9

RPS6KL1, Ribosomal protein S6 kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1Q9Y6S9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KL1Q9Y6S9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KL1Q9Y6S9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KL1Q9Y6S9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KL1Q9Y6S9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KL1Q9Y6S9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KL1Q9Y6S9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPS6KL1Q9Y6S9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPS6KL1Q9Y6S9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KL1Q9Y6S9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms