Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N1

COX11, Cytochrome c oxidase assembly protein COX11, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX11Q9Y6N1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX11Q9Y6N1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX11Q9Y6N1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms