Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H5

SNCAIP, Synphilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAIPQ9Y6H5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNCAIPQ9Y6H5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNCAIPQ9Y6H5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms