Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00312Q9Y6C7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms