Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX9Q9Y5X1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX9Q9Y5X1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX9Q9Y5X1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms