Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E5

PCDHB4, Protocadherin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB4Q9Y5E5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB4Q9Y5E5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms