Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y512

SAMM50, Sorting and assembly machinery component 50 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMM50Q9Y512 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMM50Q9Y512 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMM50Q9Y512 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMM50Q9Y512 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMM50Q9Y512 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMM50Q9Y512 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMM50Q9Y512 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMM50Q9Y512 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMM50Q9Y512 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMM50Q9Y512 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMM50Q9Y512 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMM50Q9Y512 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMM50Q9Y512 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMM50Q9Y512 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMM50Q9Y512 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMM50Q9Y512 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMM50Q9Y512 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMM50Q9Y512 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMM50Q9Y512 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMM50Q9Y512 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMM50Q9Y512 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMM50Q9Y512 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMM50Q9Y512 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMM50Q9Y512 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMM50Q9Y512 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAMM50Q9Y512 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAMM50Q9Y512 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAMM50Q9Y512 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAMM50Q9Y512 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAMM50Q9Y512 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAMM50Q9Y512 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAMM50Q9Y512 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAMM50Q9Y512 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAMM50Q9Y512 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAMM50Q9Y512 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMM50Q9Y512 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SAMM50Q9Y512 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAMM50Q9Y512 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAMM50Q9Y512 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAMM50Q9Y512 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms