Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMED7Q9Y3B3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMED7Q9Y3B3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms