Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX24Q9Y343 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNX24Q9Y343 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX24Q9Y343 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms