Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM6

CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6Q9ULM6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT6Q9ULM6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms