Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PALD1Q9ULE6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PALD1Q9ULE6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms