Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU7

ACAD8, Isobutyryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD8Q9UKU7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACAD8Q9UKU7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAD8Q9UKU7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.3 ms