Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MID2Q9UJV3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MID2Q9UJV3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms