Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS0

RPS6KB2, Ribosomal protein S6 kinase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB2Q9UBS0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KB2Q9UBS0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS6KB2Q9UBS0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms