Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
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